Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms