Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SKIDA1Q1XH10 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIDA1Q1XH10 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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