Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q1T7F1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q1T7F1 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q1T7F1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q1T7F1 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q1T7F1 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q1T7F1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q1T7F1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q1T7F1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q1T7F1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q1T7F1 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q1T7F1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q1T7F1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q1T7F1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q1T7F1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q1T7F1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q1T7F1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q1T7F1 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q1T7F1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q1T7F1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Q1T7F1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q1T7F1 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q1T7F1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q1T7F1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q1T7F1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q1T7F1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q1T7F1 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q1T7F1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q1T7F1 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q1T7F1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q1T7F1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q1T7F1 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q1T7F1 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q1T7F1 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q1T7F1 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q1T7F1 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Q1T7F1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q1T7F1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q1T7F1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q1T7F1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q1T7F1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q1T7F1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q1T7F1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q1T7F1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q1T7F1 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q1T7F1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q1T7F1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q1T7F1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q1T7F1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q1T7F1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q1T7F1 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q1T7F1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q1T7F1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q1T7F1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q1T7F1 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q1T7F1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms