Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP6V1FQ16864 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATP6V1FQ16864 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms