Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TNXAQ16473 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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TNXAQ16473 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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TNXAQ16473 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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TNXAQ16473 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TNXAQ16473 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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