Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC6Q16204 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC6Q16204 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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