Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP6AP1Q15904 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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