Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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PRKD1Q15139 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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PRKD1Q15139 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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PRKD1Q15139 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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PRKD1Q15139 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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PRKD1Q15139 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PRKD1Q15139 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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PRKD1Q15139 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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PRKD1Q15139 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRKD1Q15139 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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