Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERC3Q15034 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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