Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMD6Q15008 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMD6Q15008 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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