Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NR1D2Q14995 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1D2Q14995 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1D2Q14995 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1D2Q14995 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1D2Q14995 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1D2Q14995 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1D2Q14995 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1D2Q14995 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1D2Q14995 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1D2Q14995 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1D2Q14995 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1D2Q14995 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1D2Q14995 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1D2Q14995 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1D2Q14995 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1D2Q14995 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1D2Q14995 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1D2Q14995 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1D2Q14995 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1D2Q14995 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1D2Q14995 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1D2Q14995 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1D2Q14995 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1D2Q14995 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1D2Q14995 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1D2Q14995 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1D2Q14995 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1D2Q14995 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1D2Q14995 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1D2Q14995 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1D2Q14995 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1D2Q14995 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1D2Q14995 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1D2Q14995 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1D2Q14995 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1D2Q14995 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1D2Q14995 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms