Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMCO1Q147U7 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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