Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CDK13Q14004 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CDK13Q14004 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CDK13Q14004 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
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