Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNTB1Q13884 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms