Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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