Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PMS2P11Q13670 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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