Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CUL3Q13618 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CUL3Q13618 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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