Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EIF4EBP1Q13541 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EIF4EBP1Q13541 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms