Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C1orf61Q13536 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C1orf61Q13536 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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