Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms