Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SKP2Q13309 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKP2Q13309 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms