Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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ERCC8Q13216 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ERCC8Q13216 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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ERCC8Q13216 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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ERCC8Q13216 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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ERCC8Q13216 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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ERCC8Q13216 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ERCC8Q13216 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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