Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DUSP4Q13115 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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