Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHAF1BQ13112 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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