Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTP4A2Q12974 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTP4A2Q12974 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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