Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHD3Q12873 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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