Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAD51Q06609 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAD51Q06609 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAD51Q06609 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAD51Q06609 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAD51Q06609 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAD51Q06609 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAD51Q06609 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAD51Q06609 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAD51Q06609 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAD51Q06609 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAD51Q06609 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAD51Q06609 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAD51Q06609 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAD51Q06609 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
RAD51Q06609 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAD51Q06609 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAD51Q06609 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAD51Q06609 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
RAD51Q06609 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAD51Q06609 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAD51Q06609 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms