Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF85Q03923 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF85Q03923 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms