Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPARDQ03181 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPARDQ03181 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms