Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD1P98174 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD1P98174 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD1P98174 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD1P98174 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD1P98174 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD1P98174 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD1P98174 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD1P98174 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD1P98174 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD1P98174 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD1P98174 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD1P98174 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD1P98174 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGD1P98174 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD1P98174 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD1P98174 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD1P98174 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD1P98174 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD1P98174 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD1P98174 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD1P98174 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD1P98174 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD1P98174 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD1P98174 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD1P98174 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD1P98174 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD1P98174 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD1P98174 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD1P98174 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD1P98174 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD1P98174 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD1P98174 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD1P98174 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD1P98174 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD1P98174 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD1P98174 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD1P98174 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD1P98174 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD1P98174 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD1P98174 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD1P98174 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD1P98174 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD1P98174 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD1P98174 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD1P98174 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD1P98174 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD1P98174 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD1P98174 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD1P98174 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD1P98174 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD1P98174 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD1P98174 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD1P98174 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD1P98174 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD1P98174 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD1P98174 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD1P98174 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD1P98174 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD1P98174 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD1P98174 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD1P98174 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD1P98174 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD1P98174 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD1P98174 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD1P98174 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD1P98174 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD1P98174 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD1P98174 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD1P98174 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD1P98174 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD1P98174 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD1P98174 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD1P98174 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD1P98174 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD1P98174 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD1P98174 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD1P98174 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD1P98174 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD1P98174 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD1P98174 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD1P98174 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD1P98174 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD1P98174 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD1P98174 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD1P98174 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD1P98174 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD1P98174 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD1P98174 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD1P98174 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD1P98174 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD1P98174 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD1P98174 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD1P98174 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD1P98174 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD1P98174 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD1P98174 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD1P98174 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD1P98174 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD1P98174 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms