Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKP1P63208 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKP1P63208 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SKP1P63208 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKP1P63208 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKP1P63208 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SKP1P63208 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKP1P63208 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SKP1P63208 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKP1P63208 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKP1P63208 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKP1P63208 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKP1P63208 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKP1P63208 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SKP1P63208 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SKP1P63208 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SKP1P63208 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP1P63208 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP1P63208 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP1P63208 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP1P63208 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP1P63208 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP1P63208 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP1P63208 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP1P63208 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP1P63208 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP1P63208 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP1P63208 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP1P63208 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP1P63208 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP1P63208 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP1P63208 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP1P63208 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP1P63208 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP1P63208 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP1P63208 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP1P63208 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP1P63208 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP1P63208 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP1P63208 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP1P63208 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP1P63208 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP1P63208 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP1P63208 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP1P63208 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP1P63208 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP1P63208 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP1P63208 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP1P63208 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SKP1P63208 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP1P63208 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP1P63208 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP1P63208 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP1P63208 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP1P63208 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP1P63208 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP1P63208 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP1P63208 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP1P63208 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP1P63208 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP1P63208 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP1P63208 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP1P63208 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP1P63208 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP1P63208 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP1P63208 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP1P63208 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP1P63208 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP1P63208 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP1P63208 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP1P63208 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP1P63208 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP1P63208 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKP1P63208 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP1P63208 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP1P63208 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP1P63208 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP1P63208 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP1P63208 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP1P63208 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP1P63208 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP1P63208 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP1P63208 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP1P63208 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP1P63208 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP1P63208 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP1P63208 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP1P63208 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP1P63208 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP1P63208 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP1P63208 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP1P63208 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP1P63208 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP1P63208 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP1P63208 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP1P63208 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP1P63208 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP1P63208 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP1P63208 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKP1P63208 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms