Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ABCE1P61221 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCE1P61221 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCE1P61221 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCE1P61221 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCE1P61221 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCE1P61221 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCE1P61221 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCE1P61221 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCE1P61221 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCE1P61221 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCE1P61221 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCE1P61221 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCE1P61221 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCE1P61221 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCE1P61221 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCE1P61221 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCE1P61221 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCE1P61221 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCE1P61221 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms