Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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TMEM258P61165 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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TMEM258P61165 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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TMEM258P61165 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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TMEM258P61165 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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TMEM258P61165 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM258P61165 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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