Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EEFSECP57772 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EEFSECP57772 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms