Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRPF1P55201 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms