Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARFIP2P53365 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms