Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLK1P49759 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLK1P49759 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLK1P49759 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLK1P49759 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLK1P49759 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLK1P49759 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLK1P49759 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLK1P49759 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLK1P49759 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLK1P49759 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CLK1P49759 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLK1P49759 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLK1P49759 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLK1P49759 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLK1P49759 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLK1P49759 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLK1P49759 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLK1P49759 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLK1P49759 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLK1P49759 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLK1P49759 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLK1P49759 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLK1P49759 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLK1P49759 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLK1P49759 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLK1P49759 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLK1P49759 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLK1P49759 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLK1P49759 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLK1P49759 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLK1P49759 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLK1P49759 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLK1P49759 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLK1P49759 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLK1P49759 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLK1P49759 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLK1P49759 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLK1P49759 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLK1P49759 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLK1P49759 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLK1P49759 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLK1P49759 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLK1P49759 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLK1P49759 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLK1P49759 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLK1P49759 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLK1P49759 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLK1P49759 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLK1P49759 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLK1P49759 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLK1P49759 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLK1P49759 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLK1P49759 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLK1P49759 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLK1P49759 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLK1P49759 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLK1P49759 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLK1P49759 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLK1P49759 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLK1P49759 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLK1P49759 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLK1P49759 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLK1P49759 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLK1P49759 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLK1P49759 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLK1P49759 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLK1P49759 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLK1P49759 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLK1P49759 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLK1P49759 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLK1P49759 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLK1P49759 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLK1P49759 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLK1P49759 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLK1P49759 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLK1P49759 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLK1P49759 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLK1P49759 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLK1P49759 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLK1P49759 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLK1P49759 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLK1P49759 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLK1P49759 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLK1P49759 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLK1P49759 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLK1P49759 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLK1P49759 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLK1P49759 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLK1P49759 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLK1P49759 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLK1P49759 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLK1P49759 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLK1P49759 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLK1P49759 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLK1P49759 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLK1P49759 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLK1P49759 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLK1P49759 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLK1P49759 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms