Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCLMP48507 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCLMP48507 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCLMP48507 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCLMP48507 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCLMP48507 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCLMP48507 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCLMP48507 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCLMP48507 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCLMP48507 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCLMP48507 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCLMP48507 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCLMP48507 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCLMP48507 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCLMP48507 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCLMP48507 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GCLMP48507 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCLMP48507 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCLMP48507 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCLMP48507 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCLMP48507 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCLMP48507 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GCLMP48507 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCLMP48507 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCLMP48507 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCLMP48507 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCLMP48507 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GCLMP48507 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCLMP48507 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCLMP48507 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCLMP48507 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCLMP48507 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCLMP48507 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCLMP48507 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCLMP48507 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCLMP48507 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCLMP48507 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCLMP48507 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCLMP48507 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCLMP48507 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GCLMP48507 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCLMP48507 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCLMP48507 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GCLMP48507 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCLMP48507 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCLMP48507 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCLMP48507 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GCLMP48507 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCLMP48507 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCLMP48507 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCLMP48507 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GCLMP48507 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCLMP48507 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCLMP48507 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCLMP48507 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCLMP48507 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCLMP48507 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCLMP48507 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCLMP48507 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCLMP48507 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCLMP48507 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCLMP48507 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCLMP48507 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCLMP48507 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GCLMP48507 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCLMP48507 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCLMP48507 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCLMP48507 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCLMP48507 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCLMP48507 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCLMP48507 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCLMP48507 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCLMP48507 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCLMP48507 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCLMP48507 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCLMP48507 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCLMP48507 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCLMP48507 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCLMP48507 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCLMP48507 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCLMP48507 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCLMP48507 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCLMP48507 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCLMP48507 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCLMP48507 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCLMP48507 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCLMP48507 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCLMP48507 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCLMP48507 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCLMP48507 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCLMP48507 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCLMP48507 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GCLMP48507 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCLMP48507 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCLMP48507 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GCLMP48507 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GCLMP48507 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GCLMP48507 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GCLMP48507 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GCLMP48507 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms