Protein–RNA interactions for Protein: P47914

RPL29, 60S ribosomal protein L29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL29P47914 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL29P47914 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL29P47914 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL29P47914 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL29P47914 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL29P47914 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL29P47914 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL29P47914 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL29P47914 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL29P47914 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL29P47914 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL29P47914 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL29P47914 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL29P47914 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL29P47914 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL29P47914 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL29P47914 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL29P47914 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL29P47914 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL29P47914 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL29P47914 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL29P47914 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL29P47914 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL29P47914 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL29P47914 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL29P47914 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL29P47914 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL29P47914 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL29P47914 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL29P47914 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL29P47914 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL29P47914 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL29P47914 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL29P47914 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL29P47914 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL29P47914 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL29P47914 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL29P47914 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL29P47914 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL29P47914 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL29P47914 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL29P47914 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL29P47914 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL29P47914 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL29P47914 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL29P47914 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL29P47914 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL29P47914 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL29P47914 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL29P47914 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL29P47914 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL29P47914 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL29P47914 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL29P47914 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL29P47914 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL29P47914 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL29P47914 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL29P47914 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL29P47914 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL29P47914 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL29P47914 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL29P47914 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL29P47914 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL29P47914 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL29P47914 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL29P47914 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL29P47914 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL29P47914 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL29P47914 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL29P47914 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL29P47914 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL29P47914 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL29P47914 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL29P47914 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL29P47914 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL29P47914 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL29P47914 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL29P47914 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL29P47914 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL29P47914 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL29P47914 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL29P47914 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL29P47914 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL29P47914 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL29P47914 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL29P47914 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL29P47914 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL29P47914 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL29P47914 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL29P47914 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL29P47914 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL29P47914 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL29P47914 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL29P47914 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL29P47914 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL29P47914 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL29P47914 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL29P47914 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL29P47914 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL29P47914 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms