Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ITGAEP38570 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGAEP38570 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms