Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ATP6V1E1P36543 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms