Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTX2P32243 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTX2P32243 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTX2P32243 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTX2P32243 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTX2P32243 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTX2P32243 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTX2P32243 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTX2P32243 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTX2P32243 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTX2P32243 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTX2P32243 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTX2P32243 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTX2P32243 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTX2P32243 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTX2P32243 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTX2P32243 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTX2P32243 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTX2P32243 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTX2P32243 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTX2P32243 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTX2P32243 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTX2P32243 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
OTX2P32243 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTX2P32243 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTX2P32243 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTX2P32243 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTX2P32243 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTX2P32243 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTX2P32243 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTX2P32243 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTX2P32243 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTX2P32243 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTX2P32243 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
OTX2P32243 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
OTX2P32243 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OTX2P32243 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OTX2P32243 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
OTX2P32243 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
OTX2P32243 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OTX2P32243 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OTX2P32243 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTX2P32243 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTX2P32243 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTX2P32243 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTX2P32243 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTX2P32243 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTX2P32243 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTX2P32243 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
OTX2P32243 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
OTX2P32243 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
OTX2P32243 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTX2P32243 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTX2P32243 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTX2P32243 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTX2P32243 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTX2P32243 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTX2P32243 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTX2P32243 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OTX2P32243 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTX2P32243 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTX2P32243 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTX2P32243 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTX2P32243 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTX2P32243 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTX2P32243 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
OTX2P32243 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTX2P32243 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTX2P32243 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTX2P32243 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTX2P32243 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTX2P32243 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTX2P32243 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTX2P32243 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTX2P32243 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTX2P32243 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTX2P32243 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTX2P32243 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTX2P32243 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTX2P32243 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTX2P32243 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTX2P32243 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
OTX2P32243 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTX2P32243 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTX2P32243 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTX2P32243 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTX2P32243 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
OTX2P32243 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTX2P32243 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTX2P32243 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTX2P32243 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
OTX2P32243 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTX2P32243 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTX2P32243 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTX2P32243 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTX2P32243 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTX2P32243 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTX2P32243 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTX2P32243 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTX2P32243 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms