Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms