Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA3P26006 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA3P26006 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms