Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRDP23468 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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