Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPS6KB1P23443 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS6KB1P23443 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms