Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EPHA1P21709 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms