Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRF1P14222 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRF1P14222 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRF1P14222 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRF1P14222 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRF1P14222 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRF1P14222 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRF1P14222 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRF1P14222 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRF1P14222 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRF1P14222 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRF1P14222 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRF1P14222 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRF1P14222 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRF1P14222 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRF1P14222 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRF1P14222 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRF1P14222 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRF1P14222 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRF1P14222 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRF1P14222 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRF1P14222 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRF1P14222 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRF1P14222 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRF1P14222 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRF1P14222 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRF1P14222 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRF1P14222 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRF1P14222 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRF1P14222 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRF1P14222 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRF1P14222 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRF1P14222 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRF1P14222 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRF1P14222 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PRF1P14222 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRF1P14222 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRF1P14222 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRF1P14222 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRF1P14222 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRF1P14222 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRF1P14222 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRF1P14222 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRF1P14222 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PRF1P14222 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PRF1P14222 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRF1P14222 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRF1P14222 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRF1P14222 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRF1P14222 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRF1P14222 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRF1P14222 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRF1P14222 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRF1P14222 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRF1P14222 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PRF1P14222 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRF1P14222 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRF1P14222 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRF1P14222 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRF1P14222 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRF1P14222 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRF1P14222 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRF1P14222 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRF1P14222 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRF1P14222 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRF1P14222 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRF1P14222 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRF1P14222 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRF1P14222 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRF1P14222 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRF1P14222 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRF1P14222 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRF1P14222 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRF1P14222 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PRF1P14222 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PRF1P14222 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRF1P14222 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRF1P14222 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRF1P14222 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRF1P14222 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PRF1P14222 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRF1P14222 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRF1P14222 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRF1P14222 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRF1P14222 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRF1P14222 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRF1P14222 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRF1P14222 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRF1P14222 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRF1P14222 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRF1P14222 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRF1P14222 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRF1P14222 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRF1P14222 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRF1P14222 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRF1P14222 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRF1P14222 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRF1P14222 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRF1P14222 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRF1P14222 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms