Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ITGAVP06756 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGAVP06756 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms