Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED1O96006 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED1O96006 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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